生物学杂志

2021, v.38;No.219(01) 18-22

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联合CGGA-TCGA数据库挖掘胶质瘤显著生存相关基因
Identification of genes associated with cancer prognosis in glioma based on Chinese glioma genome atlas and the cancer genome atlas databases

吕俊杰;张一骅;邓贵;刘佳欣;吕正禹;任付宾;陈丽娜;

摘要(Abstract):

利用CGGA与TCGA数据库,挖掘胶质瘤预后标志相关基因,结合差异分析、生存分析、共表达分析、临床相关性分析和ROC曲线评估预测能力,并通过TCGA验证,得到PLAT、IGFBP2、BCAT1和SERPINH1等4个可以作为独立预后标志因子的基因。分析表明,这4个基因不仅是独立的预后因子,还在不同人群中都具有较好的预后预测能力,说明找到的预后基因具有潜在的应用价值。对SERPINH1剪接事件进行分析,揭示可变剪接事件是影响患者预后的重要因素,这为进一步理解胶质瘤预后基因的特征提供了依据。

关键词(KeyWords): 胶质瘤;生存分析;预后因子;选择性剪接

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 黑龙江省卫生厅基金项目(2018478)

作者(Author): 吕俊杰;张一骅;邓贵;刘佳欣;吕正禹;任付宾;陈丽娜;

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参考文献(References):

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