生物学杂志

2021, v.38;No.219(01) 23-28

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基于药物重定位策略预测治疗多发性骨髓瘤的候选化合物
Prediction of candidate compounds for treatment of multiple myeloma (MM) based on drug reposition strategy

邹敏;李锐峰;陈岷;颜晓燕;史惠卿;

摘要(Abstract):

采用药物重定位(Drug repositioning,DR)策略预测多发性骨髓瘤的候选化合物,为多发性骨髓瘤的治疗提供新的思路和方向。利用GEO数据库检索并筛选多发性骨髓瘤表达谱芯片数据,GEO2R软件提取差异表达基因(DEGs);DAVID和Panther数据库对差异表达基因进行富集和通路分析;利用STRING数据库构建蛋白-蛋白相互作用网络分析;将差异表达基因导入CMAP连接图,计算获得治疗MM的候选化合物,进一步对候选化合物进行查找和分析。结果显示:共获得差异表达基因53个,包括上调差异表达基因10个、下调差异表达基因43个;GO分析结果表明生物学过程涉及22个功能簇,分子功能涉及5个功能簇,细胞成分涉及5个功能簇;KEGG分析涉及10条通路;蛋白-蛋白相互作用网络分析显示VCAM1、CCR2、CCL3和CXCL12等4个基因为富集程度最高的核心差异表达基因;通过CMAP连接图计算得到排名前20的候选化合物,其中LY-294002和Tanespimycin可能对MM有潜在治疗作用,但还有待深入试验研究和临床验证。

关键词(KeyWords): 药物重定位;多发性骨髓瘤;差异表达基因;候选化合物;生物信息学

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 成都医学院校基金科研项目(编号20180376)

作者(Author): 邹敏;李锐峰;陈岷;颜晓燕;史惠卿;

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参考文献(References):

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